Istituzione nata nel 1917 come Museo Civico del Risorgimento con finalità prevalentemente patriottiche. I temi dell'allestimento iniziale andavano dai primi moti rivoluzionari fino all'epopea dei Mille. Il rialllestimento del Museo nel 1959 non si discosta dai temi della sua fondazione, ma viene aggiunta una sezione dedicata alla Resistenza. Poi nel 1995 dopo venti anni di chiusura ha riaperto come Museo storico della città di Bergamo.